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超20萬個(gè)計(jì)算模型 打造全球最大數(shù)字微生物寶庫！
2025年02月19日 10:47:38
來源：化工儀器網(wǎng) 點(diǎn)擊量：4278
全球最大的數(shù)字微生物庫——“阿波羅”包含了247092個(gè)計(jì)算模型，其中包括迄今為止最為完整的人體微生物組計(jì)算模型。
來自愛爾蘭、法國和意大利的科研人員合作，共同創(chuàng)建了全球規(guī)模最大的數(shù)字微生物數(shù)據(jù)庫——“阿波羅”(APOLLO)。該數(shù)據(jù)庫包含了247092個(gè)計(jì)算模型，其中包括迄今為止最為完整的人體微生物組計(jì)算模型。
研究團(tuán)隊(duì)主要關(guān)注了細(xì)菌微生物組，即存在于人體內(nèi)外的細(xì)菌群落。他們根據(jù)實(shí)際樣本，構(gòu)建了14451個(gè)微生物群落的計(jì)算模型，每個(gè)模型都展示了這些群落內(nèi)不同微生物的代謝過程如何因身體部位、年齡和健康狀況的不同而發(fā)生變化。
這些計(jì)算模型涵蓋了身體的不同部位，跨越了不同的年齡段，是迄今為止最為全面的人類微生物組計(jì)算模型集合。“阿波羅”項(xiàng)目還預(yù)測了與克羅恩病、帕金森病和兒童營養(yǎng)不良相關(guān)的關(guān)鍵代謝物，為開發(fā)新的診斷和治療方法提供了寶貴的線索。
研究團(tuán)隊(duì)表示，這一數(shù)據(jù)庫將成為科學(xué)家探索微生物在人體內(nèi)功能、微生物與健康和疾病相互作用的新利器，降低對(duì)繁瑣的活體生物實(shí)驗(yàn)的依賴。
這一成就源自團(tuán)隊(duì)長達(dá)十年的專業(yè)積累，從最初涉及數(shù)百種微生物的“腸道微生物代謝重建與分析”(AGORA)項(xiàng)目，到后續(xù)擴(kuò)展至數(shù)千種微生物的AGORA2，直至今日的“阿波羅”項(xiàng)目。
研究團(tuán)隊(duì)指出，借助“阿波羅”系統(tǒng)，科學(xué)家能夠通過識(shí)別微生物代謝標(biāo)志物來開發(fā)非侵入性的診斷工具，從而實(shí)現(xiàn)更早且更準(zhǔn)確的疾病診斷。這些模擬實(shí)驗(yàn)不僅能預(yù)測個(gè)體的微生物組與飲食、藥物和健康狀況之間的相互作用，還能為精準(zhǔn)醫(yī)療提供依據(jù)，例如定制化的益生菌、益生元以及基于微生物組的個(gè)性化療法。這將有助于每個(gè)人更好地管理腸道健康，并針對(duì)特定疾病進(jìn)行更有效的治療。
此項(xiàng)技術(shù)進(jìn)步無疑為醫(yī)學(xué)領(lǐng)域帶來了新的希望，尤其是對(duì)于那些依賴于早期診斷和個(gè)性化治療方案的慢性疾病患者而言。同時(shí)，這也提示我們未來醫(yī)療的發(fā)展方向可能更加注重個(gè)體化和精準(zhǔn)化，以期達(dá)到更好的治療效果。相關(guān)論文發(fā)表于最新一期《細(xì)胞系統(tǒng)》雜志。
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