PCR基因擴增儀反應條件的選擇
  PCR反應一般設置20~40次循環，每一循環包括高溫變性、低溫退火、中溫延伸三步反應。每一循環的產物作為下一個循環的模板。PCR的擴增效率很高，如果循環次數是30次，那么新生DN段理論上達到230拷貝（約為109個分子）。 PCR反應每個循環的三個基本反應步驟如下：①模板DNA的變性：模板DNA經加熱至94℃左右一定時間后，使模板DNA雙鏈或經PCR擴增形成的雙鏈DNA產物解離，使之成為單鏈，以便它與引物結合，為下輪反應作準備；②模板DNA與引物的退火（復性）：模板DNA經加熱變性成單鏈后，溫度降至55℃左右，引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合；③引物的延伸：溫度升到72℃左右，DNA模板－引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下，以dNTP為反應原料，靶序列為模板，按堿基配對與半保留復制原理，合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈。重復循環變性--退火--延伸三過程，就可獲得更多的“半保留復制鏈”，而且這種新鏈又可成為下次循環的模板。每完成一個循環需 2～4分鐘，2～3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。到達平臺期（Plateau）所需循環次數取決于樣品中模板的拷貝。 PCR技術的特異性取決于引物與模板結合的特異性。 PCR儀也叫基因擴增儀，PCR基因擴增儀是利用PCR技術對特定基因做體外的大量合成，用于以檢測DNA/RNA為目的的各種基因分析。

  溫度參數：
1、變性：模板變性*與否是PCR成功的關鍵，一般先于94℃（或95℃）變性3～10min，接著94℃變性30～60s。
2、退火：基因擴增儀退火溫度一般低于引物本身變性溫度5℃。引物長度在15～25bp可通過公Tm=(G+C)×4℃+(A+T)×2℃計算退火溫度，一般退火溫度在40～60℃之間，時間為30～45s。如果(G+C)低于50%，退火溫度應低于55℃。較高的退火溫度可提高反應的特異性。
3、延伸：延伸溫度應在Taq酶的適溫度范圍之內，一般在70～75℃。延伸時間要根據DNA聚合酶的延伸速度和目的擴增片段的長度確定，通常對于1kb以內的片段1min是夠用的。
循環數：
PCR的循環數主要由模板DNA的量決定，一般20～30次循環數較合適，過多的循環數會增加非特異擴增產物，具體要多少循環數可通過預試驗確定。
PCR產物積累規律：
反應初期產物以2n呈指數形式增加，至一定的循環數后，引物、模板、DNA聚合酶形成一種平衡，產物進入一個緩慢增長時期（“停滯效應”），即“平臺期”。到達平臺期所需PCR循環數與模板量、PCR擴增效率、聚合酶種類、非特異產物竟爭有關。