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Ribo-seq技術服務

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上海藍夢生物醫藥科技有限公司2020年9月成立,是一家專業從事生命科學產品開發的科技公司。 目前,本公司自主研發產品為功能性磁性材料,主要應用于基因檢測相關領域,包括臨床檢測、農業育種 、科學研究、食品安全等。可為廣大客戶提供我司自主品牌和代理品牌的多種產品,包括核酸提取純化試劑,核酸和蛋白定量檢測試劑,無細胞蛋白表達系統,NGS建庫試劑,LabChip GX Touch自動化電泳儀(核酸分析),芯片,mich磁力架,磁珠,自動化液體工作站,自動化建庫工作站,自動化核酸提取儀 等等。

核酸提取純化試劑,核酸和蛋白定量檢測試劑,無細胞蛋白表達系統,NGS建庫試劑,LabChip GX Touch自動化電泳儀(核酸分析),芯片,mich磁力架,磁珠,自動化液體工作站,自動化建庫工作站,自動化核酸提取儀 等等

Ribo-seq技術服務


技術原理

蛋白質是生命活動的主要承擔者,翻譯調控又是細胞內最重要的調控方式。翻譯是核糖體讀取mRNA模板來指導蛋白質合成的過程,是基因表達的關鍵步驟。翻譯的過程受到嚴格的調控,很多疾病與翻譯異常相關,比如神經退行性疾病、貧血癥和發育障礙等。雖然核糖體的結構與功能研究的比較透徹,但是對于翻譯過程的調控機理還需要深入研究。

核糖體印跡測序(Ribosome profiling, Ribo-seq),能夠詳細檢測體內的翻譯狀態。Ribo-seq的技術核心是識別與核糖體結合的mRNA以及正在被翻譯的約30個核苷酸。對核糖體結合的mRNA片段進行測序,能夠精確記錄核糖體在翻譯過程中的位置。將轉錄組與Ribo-seq數據聯合分析,可以計算出蛋白質的合成速率。

Ribo-seq技術服務


技術特點

Ribo-seq能夠揭示蛋白合成的時間、地點、位置、哪些蛋白質正在被合成以及蛋白質合成的調控機制。Ribo-seq搭建了從轉錄組學到蛋白質組學之間的橋梁,已經廣泛應用在動物、植物和微生物的研究中,用于揭示生長發育、形態建成、疾病發生、逆境脅迫響應的調控機制。


應用方向

Ribo-seq應用于研究轉錄本的翻譯活性、鑒定翻譯起始位點、ORF位置和蛋白質的翻譯調控機制。

Ribo-seq技術已經廣泛應用在動物、植物和微生物的研究中,用于揭示生長發育、形態建成、疾病發生、逆境脅迫響應的調控機制。總之,Ribo-seq能從基因組水平檢測蛋白質的翻譯狀況,獲得正在翻譯的mRNA序列信息并解析翻譯調控機制。


我們的服務優勢

實驗周期快、質量高、結果穩定可靠;

豐富的物種經驗。


送樣要求

(1)細胞樣本:建議送樣量5×106~1×107個;

(2)動物組織樣本:建議送樣量≥300 mg;

(3)植物組織樣本:建議送樣量≥500 mg。


樣本分組

至少2組樣品,包括對照組和實驗組,樣本數建議:3 VS 3。



生信分析內容

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實驗案例

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參考文獻

Brar GA, Weissman JS. Ribosome profiling reveals the what, when, where and how of protein synthesis. Nat Rev Mol Cell Biol. 2015. 16(11):651-664.

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Ingolia NT, Brar GA, Rouskin S, McGeachy AM, Weissman JS. The ribosome profiling strategy for monitoring translation in vivo by deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments. Nat Protoc. 2012. 7(8):1534-1550.

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Sawyer EB, Cortes T. Ribosome profiling enhances understanding of mycobacterial translation. Front Microbiol. 2022. 13:976550.

Xiang Y, Huang W, Tan L, Chen T, He Y, Irving PS, Weeks KM, Zhang QC, Dong X. Pervasive downstream RNA hairpins dynamically dictate start-codon selection. Nature. 2023. 621(7978):423-430.

Xu G, Greene GH, Yoo H, Liu L, Marqués J, Motley J, Dong X. Global translational reprogramming is a fundamental layer of immune regulation in plants. Nature. 2017. 545(7655):487-490.


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