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從頭測序的優勢與應用領域檢測技術服務詳情介紹
在dànbáizhì組學研究中,大多數質譜數據分析依賴于數據庫搜索法(Database Search),即通過已知dànbáizhì序列對實驗質譜圖譜進行匹配。從頭測序(De novo Sequencing)作為wánquán不依賴參考數據庫的序列解析方法,成為了解鎖未知dànbáizhì結構與功能的重要工具。
一、從頭測序的核心優勢
1、wánquán獨立于數據庫
從頭測序基于質譜儀采集的串聯質譜(MS/MS)數據,直接解析肽段的氨基酸序列,無需借助數據庫對照。對于非模式生物、環境樣本、古生物材料等缺乏注釋信息的樣本,具有天然優勢。
2、可發現數據庫中未收錄的新肽段
在腫瘤、感染或基因突變等生物學背景下,dànbáizhì表達譜可能與標準數據庫顯著不同。從頭測序可識別出新生肽段、剪接變異產物、融合蛋白等結構信息,為機制研究和靶點發現提供基礎。
3、對突變和修飾具有高度敏感性
從頭測序能夠識別非同義突變、氨基酸替換和微小插入缺失,同時支持對多種翻譯后修飾(PTMs)的解析,如磷酸化、乙酰化、糖基化等。
4、啟用多種算法提升準確率
現代從頭測序流程通常融合多種計算算法,如譜圖匹配(Tag-based)與圖論算法(Graph-based),結合機器學習輔助判讀,使得在復雜背景下的序列還原更加jīngzhǔn與高效。
二、從頭測序的主要應用領域
從頭測序廣泛應用于生命科學研究、臨床轉化、工業生物技術等多個領域。
1、基礎生命科學研究
用于功能未知dànbáizhì的結構解析
支持系統進化研究中非模式物種間的序列對比
輔助信號通路重建與功能注釋,尤其在物種特異性dànbáizhì上具有dútè價值
2、疾病機制研究與jīngzhǔn醫學
揭示突變相關的新生肽段,為個性化診療提供生物標志物基礎
識別疾病相關dànbáizhì的修飾狀態變化,如腫瘤細胞中tèyǒu的磷酸化圖譜
幫助發現潛在新抗原,支持個體化miǎnyìzhìliáo策略開發
3、抗體開發與結構確認
應用于雜交瘤或自然來源抗體序列解析,支持結構優化與zhuānlì規避
在抗體人源化與親和力成熟中,提供jīngquè序列模板
可用于雙特異抗體、多特異抗體的結構域識別與驗證
4、生物技術與工業蛋白分析
適用于合成多肽、重組蛋白等產品的序列驗證
評估生產過程中的微小變異或突變風險,增強質量控制能力
在仿制藥一致性評價中應用廣泛,尤其在蛋白結構比較環節中價值顯著
5、微生態與環境樣本研究
分析微生物群落表達的未知dànbáizhì,挖掘潛在酶資源與代謝通路
監測環境樣本中的生物標志物蛋白或外源污染物響應蛋白
輔助解析jíduān環境生物適應機制
三、從頭測序的潛在挑戰
盡管從頭測序在多個領域表現出強大能力,但仍面臨一些技術性挑戰:
1、譜圖質量要求高
從頭測序嚴重依賴高分辨率、高信噪比的MS/MS譜圖。質譜數據質量直接決定解析的準確性與覆蓋度,尤其對低豐度肽段較為敏感。
2、修飾與異構體判讀困難
部分修飾位點(如異構磷酸化、糖基化)具有相同質量信息,解析難度大。且多修飾共存情況下,肽段碎裂譜圖更為復雜,提升算法性能成為未來關鍵方向。
3、缺乏標準驗證手段
由于不依賴參考數據庫,從頭測序結果難以直接比對驗證,依賴轉錄組對照、同位素標記或人工合成驗證等方式,驗證流程復雜度較高。
從頭測序不僅是一項分析技術,更是突破數據庫壁壘、探索未知dànbáizhì結構與功能的戰略路徑。在dànbáizhì組學研究日益向個性化、多樣化、非標準化方向發展的趨勢下,從頭測序的重要性將愈加突出。百泰派克生物科技圍繞質譜組學技術不斷拓展,從平臺建設到算法優化,為科研人員和企業研發團隊提供高質量、高置信度的從頭測序服務,助力解析更廣闊的生物世界。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!