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瓊脂糖膠體電泳 (agarose gel electrophoresis)

2013-2-21  閱讀(1345)

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儀器用具:
迷你電泳槽及鑄膠器 (Mupid II);UV transilluminator 及影像分析系統;防護面罩

藥品試劑:
瓊脂糖粉末 (agarose, low EEO)
1×TAE電泳緩沖液 (40 mM Tris-acetate, 1 mM EDTA, pH 8.0):
由50×TAE (每1 L含242 g Tris base, 57.1 mL glacial acetic acid, 100 mL的0.5M EDTA-8.0) 稀釋使用。
10×追蹤染劑 (0.25% bromophenol blue, 0.25% xylene cyanol, 0.1 M EDTA, 50%glycerol)
Ethidium bromide (EtBr) stock solution:500 μg/mL,裝于滴瓶中,每50 mL膠體溶液加一滴 (zui終濃度為0.5 μg /mL)
DNA 標準分子量:
DNA/HindIII fragments:包含8 個片段23.1, 9.4, 6.5, 4.3, 2.3, 2.0, 0.56, 0.125kb ,濃度為0.5 μg/μL,以下簡稱 λMr。
1 Kb DNA Ladder Fragments: 250 bp~10 kb共14 個DNA片段,濃度為0.5 μg/μL,以下簡稱LadMr。

方法步驟:
1) 每組制備一片12-well 1.2% agarose gel: 秤取適量agarose 粉末,加入1×TAE(大片Mupid II 膠片約需40 mL),以微波爐加熱溶解后,置55℃水浴降溫。
◆ Ethidium bromide 為突變劑,以下操作請務必戴手套,并禁止戴著手套的手到處亂摸!
2) 加入EtBr (每50 mL 膠體溶液加一滴stock solution),混合均勻,將膠體溶液倒入鑄膠模,插上樣本梳。置室溫凝結后,小心拔開樣本梳,將膠片置于電泳槽中,倒入1×TAE,直至溶液蓋過膠片。
3) 樣品DNA 及DNA 標準分子量各加入1/10 體積的10×追蹤染劑。將樣品及λMr 置65℃水浴5~10 min,移至冰浴降溫后,即可加入膠片的樣品槽。
◆ LadMr 請勿加熱!
4) 以50V 或100V 進行電泳,待追蹤染劑bromophenol blue 行進至膠體三分的二處時,關閉電源,取出膠片,以UV transilluminator box 觀察色帶位置,并照相記錄結果。
◆ 請務必戴防護面罩,以免受到UV 傷害。
5) 與標準分子量比較,估計各DNA 片段的分子量并建立質體pBluescript 的限制圖譜。
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