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單細胞水平的miRNA表達譜分析
閱讀:363 發布時間:2013-10-12單細胞水平的miRNA表達譜分析
Fluidigm在C1系統上實現的第三個單細胞基因組學應用。之前,它推出了單細胞mRNA測序和單細胞基因表達分析。C1系統在去年上市,基于Fluidigm創新的微流體技術,能夠讓研究人員快速可靠地分離單個細胞并進行基因組分析。生物通 www.ebiotrade.com
microRNA(miRNA)這個小小的非編碼RNA分子,行使著重要的調控功能。研究表明,miRNA可調控數千個蛋白編碼基因,從而參與了多個生物學過程,包括分化、發育和細胞周期管理。miRNA還與許多常見病存在關聯,如癌癥和心血管疾病。
研究人員都希望揭開miRNA的更多秘密,然而,miRNA表達譜分析也存在兩方面的挑戰。首先,單個miRNA可靶定多個mRNA靶點,從而調控多個生物學系統。這種生物學現象是細胞間差異的一個促進因素,讓miRNA靶點的解釋變得困難。在單細胞水平研究miRNA的表達讓研究人員可測定同一群體中某些細胞所發生的快速、動態變化。其次,傳統的芯片分析費時費力,靈敏度不高,且內容不夠靈活。而定量PCR雖提供了比芯片更高的靈敏度,但在大規模研究時成本高、時間長。生物通 www.ebiotrade.com
如今有了C1系統和miRNA表達譜分析方案,研究人員可在不到24小時的時間內,平行處理96個單細胞,在一張GE 96.96芯片對每個單細胞分別檢測多達96種miRNA。配套的SINGuLAR™ 2.0分析軟件可以對數據進行非監督式聚類分析及PCA分析,有效地根據miRNA表達類型在單細胞水平揭示細胞群體的異質性,為研究miRNA調控提供更多數據。
C1單細胞全自動制備系統是*zui先推出的全自動單細胞分離和制備系統。C1系統為每次運行處理96個單細胞提供了簡單輕松、高度重復的流程,而手工操作所需的時間極少。它地讓分離細胞、提取、逆轉錄和擴增過程實現全面自動化,使細胞活性的檢測和分析成為可能,并減少了多平臺技術錯誤所引起的可變性。單細胞水平的miRNA表達譜分析