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美國開發出能進行邏輯操作的可存儲基因模塊

閱讀:136          發布時間:2013-5-3

  美國開發出能進行邏輯操作的可存儲基因模塊
據《自然》近日報道,美國麻省理工大學(MIT)科學家開發出一套簡單的基因模塊,能對輸入信號起反應,在活細胞中執行邏輯命令,就像計算機中所用的布爾邏輯門。研究人員指出,利用這些“基因線路”能追查一個細胞在何時到達其生命關鍵時刻,撥動基因開關改變細胞命運。相關論文發表在《自然·生物技術》雜志上。

邏輯與存儲是電子線路的兩大基本功能,由此才產生了各種復雜的反應。合成生物學旨在把電子工程中的概念引入到細胞生物學中,把基因功能作為電路組件。新研究由MIT合成生物學家蒂莫西·盧領導,他們開發的邏輯模塊以質粒為基礎,這里的質粒是一種環形的DNA鏈,將其插入大腸桿菌細胞中。并利用重組酶,將合成基因線路有效地組裝起來,不僅能執行布爾邏輯功能,還具有穩定的DNA編碼存儲功能。他們設計了16種質粒,在計算中能執行所有2-輸入-1-輸出的布爾邏輯門。

執行計算的每個變量都包含啟動子、終結子和一個“輸出基因”,啟動子和終結子能打開或中止基因轉錄,輸出基因則編碼一個綠色熒光蛋白(GFP)。系統的關鍵是利用重組酶切斷并重排啟動子和終結子DNA序列,讓它們打開或關閉。重組酶好比輸入命令,決定了輸出基因能否被轉錄。比如在電子的“與”門中,給兩個輸入點通電會輸出一個正值;而在基因“與”門中,只有當終結子序列在中間,并且啟動子序列被兩個輸入重組酶中和時,輸出基因才會被轉錄而表達出一個綠色熒光蛋白。

在以往研究中,人們也曾利用重組酶將數據寫入DNA以便存儲,而新研究將這種理念更推進了一步,使DNA本身成為計算機的一部分。盧說,如果經過修改的DNA可作為調控元素,像啟動子序列或終結子序列那樣,就能控制細胞里的某些事情。

另一位MIT合成生物學家克里斯托弗·沃伊特說,這種人造模塊是一種“極其數字化且*性的DNA信息存儲方式。它的邏輯能存儲多重經驗,如細胞曾遇到兩種環境會記住事件順序。”而且這種改變是*性的,“在細胞死亡后,這些信息還能從它的DNA中提取出來。”研究人員還發現,改變了的質粒能代代相傳,至少能傳90代。

盧還指出,這種方法在生物技術中也非常有用。這些基因開關形式簡單易于訪問,如某種藥物,商可以培養一種細胞事先關閉其關鍵基因,當系統一切就緒后,輸入某種信號化合物激活這些關鍵基因,并保持*性打開,以藥物。在達到某個臨界值時,再用其他開關來中止。
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