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士鋒生物電泳、轉(zhuǎn)膜
點(diǎn)擊次數(shù):913 發(fā)布時(shí)間:2014-5-7
轉(zhuǎn)膜是把DNA從瓊脂糖凝膠中轉(zhuǎn)移到固相支持物(一般是尼龍膜)上固定,是進(jìn)行各種后續(xù)研究(如RFLP分析,陽(yáng)性克隆的篩選驗(yàn)證等所有涉及分子雜交的研究)的前提。
實(shí)驗(yàn)?zāi)康模赫莆誗outhern Blotting的原理及操作步驟
實(shí)驗(yàn)原理:
1. 轉(zhuǎn)膜的方式:
向上的毛細(xì)管轉(zhuǎn)移
向下的毛細(xì)管轉(zhuǎn)移
同時(shí)向兩張膜轉(zhuǎn)移
電轉(zhuǎn)移
真空轉(zhuǎn)移
2. 固相支持物的種類及選擇:
硝酸纖維素膜:非共價(jià)結(jié)合,易脆,易丟失DNA,< 500 bp的DNA無(wú)效,轉(zhuǎn)膜前的工作(從提高轉(zhuǎn)膜效率,利于轉(zhuǎn)膜后使用等)
尼龍膜(帶正電荷的)高強(qiáng)度,不易破損,具有較大的DNA結(jié)合容量,它能夠吸附變性DNA,核酸以共價(jià)結(jié)合方式不可逆的結(jié)合在尼龍膜上。尼龍膜兩邊均有同樣吸附DNA功能,無(wú)論用哪邊均可以經(jīng)久耐用,可反復(fù)利用10次以上(10-20次),經(jīng)毛細(xì)管(毛細(xì)吸附)作用,把DNA從凝膠上轉(zhuǎn)到膜上。DNA轉(zhuǎn)到膜上是復(fù)制膠上的帶型,在80-100℃真空干燥2-4 hrs,即可固定DNA。
3. 轉(zhuǎn)移緩沖液(transfer buffer)的選擇:
帶正電荷的尼龍膜:可用高鹽離子強(qiáng)度(SSC),但不能充分發(fā)揮膜潛能;0.4N NaOH,共價(jià)結(jié)合DNA是zui大優(yōu)點(diǎn)。
硝酸纖維膜:高鹽離子強(qiáng)度促進(jìn)DNA與膜結(jié)合(20×SSC),低鹽離子強(qiáng)度導(dǎo)致小片段DNA在轉(zhuǎn)移過程中丟失,pH>9,DNA不能與膜結(jié)合。
4.轉(zhuǎn)膜時(shí)間(duration of transfer)約12 hrs
效率高低,但已無(wú)補(bǔ)救措施,因此,每一步應(yīng)嚴(yán)格操作。
實(shí)驗(yàn)材料及試劑:酶消化好的DNA樣品,尼龍膜,0.2N HCl,0.4N NaOH等
實(shí)驗(yàn)步驟:
1. 0.8%瓊脂糖電泳
制膠:注意瓊脂糖的質(zhì)量,膠的濃度,厚度(<5mm)及均一性。一般大電泳槽配制250ml 0.8%瓊脂糖凝膠,采用42孔梳子(經(jīng)濟(jì),)
制樣,點(diǎn)樣:DNA樣品中指示劑量稍多
電泳:一般1-1.5V/cm的電壓, 使DNA遷移到適當(dāng)距離,一般指示劑約移動(dòng)10-11cm (大電泳槽:40V×12-15hrs,小電泳槽30V×4-5 hrs)
2.轉(zhuǎn)膜前的準(zhǔn)備:
依膠大小每塊凝膠準(zhǔn)備兩張比膠稍大的濾紙(11×12.5 cm),兩張用作鹽橋的濾紙,一張與膠同樣大小的尼龍膜(10×10.5cm),兩個(gè)玻璃盤、兩塊有機(jī)玻璃板、一根玻璃棒,比尼龍膜稍大的一疊吸水紙等。
3.一玻璃盤中加入足量的0.4N NaOH,放上洗凈的玻璃板,按圖示搭制鹽橋(操作示范)。
4.凝膠的預(yù)處理:
a) 從電泳槽中移出凝膠置于塑料板上,用切膠板把膠切成適當(dāng)大小,切去右上角(zui后一個(gè)樣品的zui前端)作為電泳方向記號(hào)
b) 把凝膠翻面,放入加有足量的0.2N HCl玻璃盤中,輕輕搖動(dòng)10min,使指示劑變黃色為止(脫嘌呤)
c) 倒去HCl溶液,加蒸餾水漂洗凝膠
d) 倒去蒸餾水,加0.4N NaOH中和
e) 同時(shí)在鹽橋?yàn)V紙上灑些0.4 NaOH,立即將膠放在鹽橋上(忌氣泡)
5.膠的四周用塑料片與膠緊緊相連,防止短路(吸水紙與鹽橋相接)
6.在膠面上倒足夠量0.4N NaOH,小心放置膜(預(yù)濕0.4N NaOH)使膜覆蓋整塊膠(要求一次成功,不能移動(dòng))
7.膜上放2張濾紙,濾紙大小為15×12cm
8.放不少于5cm厚的吸水紙,放上玻板,其上壓約500g的重物,轉(zhuǎn)膜12 hrs左右
9.轉(zhuǎn)膜完畢,用2×SSC漂洗膜兩次,各五分鐘。用EB染膠以檢測(cè)轉(zhuǎn)移效果。
10.用兩張濾紙包住膜,置于80-100℃的真空干燥箱中,干燥2-4 hrs。