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植物凝膠的成膠需要二價陽離子的存在，且對pH敏感。一般植物培養基中的鈣離子和鎂離子的濃度足以讓植物凝膠凝固，鈣鎂離子減少應適當增加植物凝膠的用量；植物培養基一般調pH至5.8，pH低于5.5會嚴重影響植物凝膠凝固。微生物學研究所用的低鹽培養基，通常需要另外加入鈣鹽、鎂鹽或提高植物凝膠的加入濃度。植物凝膠常用工作濃度：MS培養基為例2.5-4 g/L；1/2 MS培養基5-8 g/L。微生物培養基10 g/L。
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