ATP熒光快速檢測儀的優勢：自然環境中存在大量的微生物，可通過對植物的附著、灰塵、空氣等污染食品。如果食用了被致病菌污染的食品，會影響身體健康。
細菌污染食品后，如果環境條件適宜，能分解食物中的營養物質如蛋白質、糖、脂肪、維生素、無機鹽等進行自身繁殖，從而導致食品營養價值和品質下降, 嚴重時造成食品腐爛變質，呈現出一定程度的使人難以接受的感官性狀，如刺激 性氣味、異常顏色、組織腐爛、產生黏液等。此外，有些細菌污染食品后會產生 毒素，如肉毒毒素、金黃色葡萄球菌腸毒素等，如果不慎食用，會造成人體中毒， 嚴重危害人體健康，甚至危及生命。因此需要使用細菌檢測儀對食品的細菌進行檢查，保證人們的食用安全。
一般食品細菌檢測方法是培養基法：指食品經過處理，在一定條件下培養后，所得1g或1ml檢樣中所含細菌菌落總數。菌落總數主要作為判別食品被污染程度的標志，也可以應用這一方法觀察細菌在食品中繁殖的動態，以便對被檢樣品進行衛生學評價時提供依據。缺點是時間長，需要置36±1℃溫箱內培養48±2h。
儀器為了滿足現場快速檢測的需求，ATP 熒光檢測儀宜選擇手持式從而實現流動狀態即時檢測。
當儀器和試劑配合使用，整體靈敏度達到10‐15‐10‐18摩爾ATP范圍時，可以用于食品表明微生物檢測、手衛生檢測、餐飲器具潔凈度檢測、重點科室和重要活動場所物表檢測和衛生安保、食品加工器具、工作臺等關鍵控制點消毒結果檢測、醫療環境工作平臺(器械表面、內窺鏡、空調進出氣口)衛生學即時評估，其實時監測數據能有效配合HACCP或GMP體系管理的要求 。
試劑 專用的 ATP 試劑盒，必須是可去除游離 ATP 和體細胞 ATP，只針對細菌細胞 ATP 檢測，所謂去除干擾物，這是基本要求。其次熒光素酶、蟲螢光素、裂解液、取樣拭子等組分最好設計成一體化，整體便于現場攜帶方便檢測使用。
如何使用
取樣是影響準確性和一致性的關鍵之一，可按照<<醫院消毒衛生標準采樣及檢查方法>>等規范要求再參照手持式ATP儀說明書采樣、檢測、計算得出結果并記錄報告。
采樣：
(面積類)將ATP拭子采樣棒一支在物體表面或雙手指曲面從指跟到指端來回涂擦個兩次(一只手涂擦面積約30cm2)，并隨之轉動采樣拭子。
(體積類)將 ATP 拭子采樣棒一支在待測液體充分浸濕。
檢測：將拭子放入手持ATP儀，獲得被測樣本與細菌污染程度相對應的ATP生物熒光值，得出菌落數指標。
結果判讀以上取樣、檢測全過程在1分鐘之內快速完成，比起 24‐48 小時的傳統細菌培養優勢巨大。細菌數量與細菌內所含ATP量有明確的相關性，通過檢測ATP含量可間接得出細菌數量，即ATP 熒光檢測儀檢測結果顯示的發光值——相對照度單位 RLU讀數與常規細菌培養法結果菌落數CFU具有很高的相關性，兩者沒有統計上的顯著差異，因此這也是ATP熒光法細菌檢測的理論基礎。
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