恒溫水槽在使用幾年后，普遍出現各種各樣的問題，比如：制冷速度變慢，噪聲變大等問題。
首先，恒溫水槽水循環使用操作簡單，但是定期的維護保養工作是不能忽略的，越簡單易懂的東西越要多加注意。很多看似為故障的問題，其實就是沒有定期對恒溫水槽做維護保養引起的。水循環本身的電功率和制冷劑從負載中帶走的熱量都需要從前通風罩處的散熱器中排除，如果前通風罩吸滿灰塵和柳棉等久會妨礙這些熱量的散發，制冷效果將大幅度的降低，如果得不到清除，容易因電熱無法散發導致儀器燒壞。一般來說在正常的使用條件下制冷量降低都是因為通風散熱效果差或者環境溫度太高引起的。
其次，前面提到的水循環維護的必要性，這個問題也息息相關。*，水里面有很少部分的雜質，就是蒸餾水在加到水箱后也不可能一點雜質都沒有。對于水循環來說，一般溫度都設置在20℃，特別適應微生物的生長和繁衍。時間長了以后這些微生物就會堵塞水路的過濾器造成回水不暢，水泵就會有較大的噪音。有時這些微生物附在了換熱器的表面，造成換熱器的傳熱效果變差，制冷量變小。所以一定要嚴格按照說明書中的要求做好日常維護工作，定時清洗內槽，停用，保持槽內干燥。水循環里面好像有漏水，有時地面一會兒就有幾滴，是不是水路上有地方泄漏？一般來說在正常使用的過程中，水路是不會有泄漏的。在環境溫度比較高空氣中的相對濕度又太大時，在水循環的水路中的水泵、水管接頭、外接水管處容易凝結露水，累積多了以后就滴到地面上了，不用擔心是水路中有漏水的地方。如果您對這很介意的話，降低房間溫度或是除濕都可以避免露水的產生。
