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李時(shí)珍出身三代相傳的醫(yī)戶人家，祖父是一個(gè)醫(yī)生，父親李言聞，又名李月池，也是當(dāng)?shù)赜忻尼t(yī)生，曾做過“太醫(yī)吏目”。他不僅有豐富的臨床經(jīng)驗(yàn)、而且在醫(yī)學(xué)理論上也有相當(dāng)?shù)男摒B(yǎng)，后來李時(shí)珍稱贊自己的父親在診斷疾病方面的知識(shí)是“精詣奧旨，淺學(xué)未能窺造”。據(jù)記載李言聞著有《四診發(fā)明》、《艾葉傳》、《人參傳》、《痘疹證治》等。李時(shí)珍從小就在這種環(huán)境中熏陶著。

在封建社會(huì)里，醫(yī)生的地位非常低下，常與“”、“賣卦”的人相提并論，有時(shí)還遭到官僚、地主和豪紳們的欺壓。這股勢(shì)力在明代更甚，當(dāng)時(shí)還規(guī)定“醫(yī)戶”人家不能改行，這種輕視醫(yī)生的社會(huì)風(fēng)氣，促使李言聞產(chǎn)生了改換醫(yī)戶地位的想法，決定讓李時(shí)珍走科舉道路，這樣可以取得一官半職，榮宗耀祖，因此，要求李時(shí)珍每天背誦《四書》、《五經(jīng)》，準(zhǔn)備迎接科舉考試。

李時(shí)珍從小愛好讀書，在14歲那年考中秀才，后來參加鄉(xiāng)試考舉人，三次都失敗了。有一年，蘄州一帶，河水上漲，淹沒了田地，又淹沒了市巷，農(nóng)田荒蕪，疫情嚴(yán)重，腸胃病到處流行。蘄州官府舉辦的“藥局”，不替窮人看病，窮人有病，都來找李時(shí)珍的父親醫(yī)治，臨走時(shí)，個(gè)個(gè)都道謝不絕。這一切都被李時(shí)珍看在眼里。李時(shí)珍20歲的那年，身患“骨蒸病”（肺結(jié)核），連續(xù)不斷地咳嗽和發(fā)燒，幾乎把命送掉，幸得父親的精心診治，用一味黃芩湯把病治好了。李時(shí)珍愈想愈不愿走科舉道路，向父親表示，立志學(xué)醫(yī)，做一個(gè)為病人解除痛苦的好醫(yī)生，父親看他態(tài)度堅(jiān)決，也只好答應(yīng)了。