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武漢艾美捷科技有限公司
初級(jí)會(huì)員 | 第6年

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快速內(nèi)切酶EcoRV,快速DNA消化方案

時(shí)間:2023/9/11閱讀:163
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FlyCut™ 酶是一系列能夠快速消化DNA的工程限制性酶。所有FlyCut™酶在通用CutOne中顯示出優(yōu)異的活性™ 和CutOne™ 彩色緩沖液,能夠在5~15分鐘內(nèi)消化DNA。這使得任何限制性酶的組合都能在一個(gè)反應(yīng)管中同時(shí)工作,并消除了連續(xù)消化的需要。FlyCut™ 酶已通過多項(xiàng)嚴(yán)格的質(zhì)量控制,可用于消化質(zhì)粒、基因組和病毒DNA以及PCR產(chǎn)物。CutOne™ Color Buffer包括密度試劑以及紅色和黃色跟蹤染料,可以將反應(yīng)混合物直接裝載在凝膠上。CutOne的紅色染料™ 彩色緩沖液在1%瓊脂糖凝膠中與2.5kb雙鏈DNA片段一起遷移,黃色染料在1%瓊脂凝膠中與10bp雙鏈DNA碎片一起遷移。

 

艾美捷快速內(nèi)切酶EcoRV

Cat #: C-BSM537

Size: 200 rxns

Storage: -20°C

 

快速內(nèi)切酶EcoRV組分:

41.png

推薦反應(yīng)條件

1x CutOne“"緩沖器;在37°C下培養(yǎng);有關(guān)反應(yīng)設(shè)置,請(qǐng)參閱“快速DNA消化方案"。

熱滅活

80°C下培養(yǎng)20分鐘。

質(zhì)量控制

功能測(cè)試

在含有1μgλDNA1μl FlyCut“"EcoRVCutOne“緩沖液中,在37°C下孵育15分鐘,20μl反應(yīng)可通過瓊脂糖凝膠電泳確定完-全消化。

長(zhǎng)時(shí)間培養(yǎng)/星形活性測(cè)定

在含有1μgλDNA1μl FlyCutEcoRVCutOne"緩沖液中,在37℃下孵育3小時(shí),反應(yīng)20μl,瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)到DNA模式?jīng)]有可檢測(cè)的核酸酶降解。長(zhǎng)期孵育可能導(dǎo)致星形活性。

結(jié)扎和清算

37℃下用FlyCut’“"EcoRV消化10倍后,在22°C下可將>95%DNA片段與T4 DNA配體連接。在這些連接的片段中,通過瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定,>95%可以用FlyCut“"EcoRV重新切割。

非特異性核酸內(nèi)切酶活性

在含有1μg超螺旋質(zhì)粒和1μl FlyCut“"EcoRVCutOne“緩沖液中,在37℃培養(yǎng)4小時(shí),進(jìn)行20μl反應(yīng),通過瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定,轉(zhuǎn)化為刻痕或線性形式的轉(zhuǎn)化率<10%

 

藍(lán)/白篩選試驗(yàn)

1μl FlyCut消化含有lacZα基因的合適載體™ EcoRV。將消化產(chǎn)物連接并轉(zhuǎn)化為大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞。在含有X-GalIPTG和適當(dāng)抗生素的Luria Bertani培養(yǎng)板上,成功連接的β-半乳糖苷酶基因可以表達(dá)并產(chǎn)生藍(lán)色菌落,而中斷基因(即降解的DNA末端)產(chǎn)生白色菌落。FlyCut™ 限制性內(nèi)切酶必須產(chǎn)生少于1%的白色菌落。

 

在推薦的反應(yīng)條件下,該酶可在5~15分鐘內(nèi)消化單位底物。酶的最適反應(yīng)溫度為37℃。

當(dāng)?shù)孜?span style="font-family: Calibri;">DNACpG甲基化酶甲基化時(shí),這種限制性酶的切割可能被阻斷或受損。

當(dāng)?shù)孜?span style="font-family: Calibri;">DNAEcoBI甲基化酶甲基化時(shí),這種限制性酶的切割可能被阻斷或受損。

該酶可以在80°C下孵育20分鐘進(jìn)行熱滅活。孵育3小時(shí)不會(huì)顯示星形活性,但孵育時(shí)間較長(zhǎng)可能會(huì)導(dǎo)致星形活性。

 

快速DNA消化方案:

① 按照指示的順序在冰上混合下列反應(yīng)組分

Plasmid DNA    PCR product    Genomic DNA

ddH?O    15μl   16μl    30μl

10x CutOne' Buffer or 10xCutOne Color Buffer2μl    3μl2    5μl

DNA    2μl(up to 1μg)   10μ(0.2μg)    10μl(5μg)

FlyCut" EcoRV 1μl   1μl    5μl

Total    20μl   30μl    50μl

對(duì)于純化的PCR產(chǎn)物。如果PCR產(chǎn)物未純化,則10×CutOne的量™ 緩沖液應(yīng)減少到2μl,以減少未純化的PCR產(chǎn)物中剩余的金屬離子。我們建議在消化前純化PCR產(chǎn)物,將其用于克隆,因?yàn)橐恍?span style="font-family: Calibri;">DNA聚合酶的核酸外切酶活性可能會(huì)改變切割DNA的末端

② 輕輕混合并向下旋轉(zhuǎn);

③ 在37°C下培養(yǎng)15分鐘(質(zhì)粒DNA)或1530分鐘(PCR產(chǎn)物)或3060分鐘(基因組DNA);

④可選:在80°C下加熱20分鐘使酶失活;

⑤如果CutOne™ 在反應(yīng)中使用顏色緩沖液,將反應(yīng)混合物的等分試樣直接裝入凝膠中。


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