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隨著多種組學研究技術的不斷發展,APExBIO向全球范圍內的科研院所、醫療機構等單位提供基于質譜分析的蛋白質組學和代謝組學服務;基于高通量測序的各種組學服務;基于計算機輔助藥物設計服務;以及各種生物信息學分析服務。
艾美捷APExBIO多組學服務解決方案:
1、基因組重測序
基因組重測序是通過高通量測序對已有參考基因組物種的基因組核酸序列進行測定的技術, 通過重測序可以分析個體或群體的遺傳差異性、群體進化等。具體策略方面,可以對全基因組序列進行測序, 即全基因組重測序;也可以只捕獲外顯子區域進行測序,即外顯子組測序。
2、ATAC-seq
ATAC-seq研究染色質可及性,測定特定時空下基因組中所有處于開放狀態的序列,分析調控元件, 揭示轉錄因子結合位點以及核小體位置,從而研究精細化基因表達的調控DNA印記等。 該方法細胞用量低至50000個,組織50mg。其信噪比與靈敏性優于其他染色質可及性研究方法, 可以在全基因組范圍內檢測染色質的開放狀態。
3、KAS-seq
研究單鏈DNA相關生物活性,如正在進行轉錄活動或參與調控轉錄活動的單鏈DNA, 可快速準 確地分析轉錄活性和增強子活性。該方法可測的多種生物學活性類型的單鏈,如轉錄,增強子等。 該方法細胞用量低至100000個,可測得多類型數據,對比相應ChIP-seq,ATAC數據或數據庫, 可以得到有單鏈生物學活性的多類型測序數據,靈敏度高。
4、RIP-seq
RNA免疫共沉淀測序技術,在體內環境中研究蛋白質與RNA相互作用的經典實驗方法, 該方法結合了 RNA 免疫沉淀和高通量測序,其中相互作用的 RNA 通過目標蛋白的免疫沉淀被捕獲。 對捕獲的 RNA 進行高通量測序有助于了解轉錄后調控網絡的動態過程。應用于RNA結合蛋白(RBPs), mRNA形成核糖核蛋白(RNPs)復合物, RNA modification等研究。
5、簡化甲基化測序
簡化甲基化測序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),是利用限制性內切酶對 基因組進行酶切,以富集CpG島以及啟動子等區域,并經Bisulfite處理后,進行單堿基分辨率的甲基化測序技術。 因其可顯著提高CpG區域的測序深度,在啟動子區域、CpG島和增強子元件區域可以獲得高精度的分辨率,在臨床樣本 的大規模研究中具有廣泛應用。
6、全轉錄組
全轉錄組測序是特定物種、組織或細胞在特定狀態下所有轉錄產物集合,包括mRNA和非編碼RNA。 目前全轉錄組測序主要檢測了mRNA、lncRNA、circRNA和miRNA。通過聯合分析,解析RNA間的相互作用及共表達 調控網絡,并且進行競爭性內源RNA(ceRNA)分析,從而更加全面解析特定的生物學過程
7、10X Genomics /GEXSCOPE/ SeekOne單細胞RNA-Seq
單細胞轉錄組測序(Single cell RNA sequencing)是在單個細胞水平對mRNA進行高通量測序的一項新技術, 針對單個細胞研究其整體水平的基因表達情況,成功解決細胞分子機制研究中常見的細胞異質性、 細胞量少而無法進行常規高通量測序等難題。單細胞測序技術具有檢測細胞之間異質性的優勢, 并且能夠識別數量很少的細胞群。
8、全蛋白組
通過新的質譜技術Data independent acquisition (DIA,數據非依賴性采集),我們對樣本中的全部蛋白 質進行所有碎片離子的全景式掃描,得到高準確性,少缺失值的蛋白鑒定及相對定量結果,為生物標志物的發現, 疾病精準分型,生理病理分析,溯源致病基因等研究提供有力支持。
9、Olink蛋白
Olink基于磚利的鄰位延伸分析技術PEA( proximity extension assay),借助蛋白特異性原理, 核苷酸序列探針及高通量測序平臺,實現對特定疾病相關蛋白的精確定量。因其極少的樣本需求量, 適應各類疾病的多種panel,精確的蛋白定量結果受到廣泛應用,聚焦人類疾病靶點蛋白,為臨床大隊列篩選、 生物標志物的復核等研究提供有力數據支撐。
10、非靶代謝/非靶脂質代謝
代謝組學是研究生命體對外界刺激、病理生理變化以及本身基因突變而引起的分子質量小于 1500Da 以內的內源性代謝產物種類、數量及其變化規律的組學,有助于生物標志物的篩選,研究代謝通路,發現調節酶, 揭示生命活動機制等研究。在疾病診斷、藥靶篩選、營養與健康管理、個性化藥物治療等領域廣泛使用。
11、微生物組
微生物組學以動植物體或環境中的所有微生物為研究對象,通過對微生物基因組進行高通量測序, 以獲得樣本中微生物群落結構、進化關系以及特定環境的微生物基因功能等。 該技術突破了傳統微生物不可培養的缺點,在疾病治療、動物健康、環境治理、農業發展等領域廣泛使用。
12、計算機輔助藥物設計
借助于APExBIO多年的實驗平臺,寶貴的實驗經驗與海量數據可以更好地為計算機輔助藥物設計提供驗證。 新興的人工智能技術與成熟的模擬計算可以更好地指導實驗的進行,打破單向干濕結合的壁壘, 實現實驗與計算的相互融合。隨著APExBIO與工業界的積極合作,從收集到的工藝數據中探索出一套優化底層研發的方式, 并提供小分子藥物設計服務、抗體藥物設計服務以及疫苗設計服務。
艾美捷科技是APExBIO的中國代理商,為科研工作者提供優質的產品與服務。
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