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近紅外二區成像（900-1700nm）與可見光成像（400-900nm）相比，因其在動物組織中的散射與吸收系數更小，因此具有更高的成像分辨率與穿透深度。近紅外二區的成像分辨率一般可達40um，能對細小的血管直接成像；穿透深度大致為2cm，即便是小鼠深的臟器發出的信號也能被檢測到。