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氣相色譜儀氣源的準備和凈化：

事先準備好需用氣體的高壓鋼瓶。一般用氮氣，氫氣，空氣這三種氣體。有的廠使用氫氣發生器和空氣壓縮機也可，但空壓機必須無油。

鋼瓶氣壓下降到1~2Mpa時，應更換氣瓶。一般建議使用純度99.999%以上氣體。

凈化氣源

為了除去各種氣體中可能含有的水分，灰分和有機氣體成分，在氣體進入氣相色譜儀之前應先經過嚴格凈化處理。

若全部使用鋼瓶氣體，有的色譜儀附有氣體凈化器，且內已填有5A分子篩，活性炭，硅膠，基本可滿足要求。

若使用一般氫氣發生器，則必須加強對水分的凈化處理，故應增大干燥管面積（體積在450立方厘米以上為好，填料用5A分子篩）,并在發生器后接容積較大的儲器桶，以減少或克服氣源壓力波動時對儀器基線的影響。

若使用空氣發生器作空氣來源，空氣發生器進氣口應加強空氣過濾，加大凈化管體積，在干燥管內應填充一半5A分子篩，一半活性炭。一般國產無油氣體壓縮機可滿足需要。

氣相色譜儀安裝與調試前確保一些配件到位：減壓閥、減壓閥轉換接頭，電腦（與工作站配套）。