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化學蛋白質組學(Chemical Proteomics)作為蛋白質組學的一個重要分支,整合了合成化學、細胞生物學和質譜學多種方法,旨在設計小分子探針以了解藥物發現中的小分子作用模式和蛋白質功能,在天然產物的背景下,化學蛋白質組學可用于識別活細胞中小分子的蛋白質結合伴侶或靶標。化學蛋白質組學由兩個關鍵步驟組成:(1)探針設計和合成;(2)目標捕撈和蛋白質鑒定。目前已經開發了4種不同類型的探針以篩選具有不同結構的小分子靶標;打靶之后,也有多種蛋白質鑒定方法,適合不同的情況。化學蛋白質組學為靶點反卷積、藥物反應生物標志物的發現以及用于臨床前靶點驗證的疾病途徑分析提供了一系列新穎的方法,在藥理學研究領域,已廣泛用于識別藥物靶點并研究其作用機制。
化學蛋白質組的應用
百泰派克生物科技(BTP)采用高分辨質譜平臺開發并驗證了jiānduān的化學蛋白質組學技術,可用于生物標志物研究、藥物和靶點發現、通路建模、作用機制研究等眾多領域,旨在為客戶提供優質、全面的靶點解卷積服務。我們提供多種方法來識別和驗證新藥物靶點,以滿足不同的需求。
設計和合成探針是化學蛋白質組學方法中靶標識別的初始和關鍵步驟。BTP提供常用的四種探針,包括(1)固定化探針:將生物活性天然產物被共價固定在生物相容性惰性樹脂上(如瓊脂糖和磁珠),例如瓊脂糖和磁珠,作為篩選活性蛋白質組中目標蛋白的誘餌;(2)基于活性的探針(ABP):ABP考慮了藥物分子的活性,在富集前可以與活性蛋白質組中的蛋白質相互作用,甚至可以穿過細胞膜與活細胞中的靶蛋白結合,潛在地反映了細胞內生理條件下真實的藥物與靶點的相互作用;(3)點擊化學探針:此類探針通過與其互補體(如疊氮化物、炔烴等)進行生物正交點擊反應,從而將探針共價連接到親和標簽(shēngwùsù-疊氮化物、shēngwùsù-環丙烷等)或熒光標簽(羅丹明-疊氮化物、FITC-疊氮化物等)上,用于后續富集和目標鑒定;(4)光親和探針:光親和探針由點擊化學探針骨架和用于固定探針與靶標之間結合的光親和基團組成,在特定波長光的照射下,光親和基團會產生高活性自由基促使活性分子與靶標共價結合。
Chen, X.;et al. Sig Transduct Target Ther. 2020.
不同類型化學蛋白質組學探針的一般分子結構
對于一些沒有適合修飾位點或修飾后影響活性的天然產物,BTP也提供基于藥物親和力響應靶點穩定性(DARTS)和熱分析蛋白質組分析的非標記化學蛋白質組學方法。DARTS依賴于通過與小分子相互作用賦予靶蛋白的蛋白水解保護,首先用目標化合物和載體對照或無活性類似物簡單處理細胞裂解物的等分試樣,然后用蛋白酶有限消化細胞裂解物中的蛋白質,隨后通過 SDS-PAGE 分離樣品并染色,以鑒定免受小分子蛋白水解的蛋白質條帶zuì后使用 MS 來識別每個條帶中存在的蛋白質。
Chen, X.;et al. Sig Transduct Target Ther. 2020.
非標記化學蛋白質組學方法流程
百泰派克生物科技化學蛋白質組學全面解決方案包括從實驗設計、樣品制備、探針合成、靶標鑒定以及數據分析的全流程,為您提供一站式的無憂服務,滿足您在藥物開發和藥物發現領域生物標志物研究、藥物和靶點發現、通路建模、藥物作用研究等的多種需求。借助我們全面的解決方案,您不會在錯誤的候選藥物上浪費時間和成本,并且能夠優化藥物開發和藥物發現計劃的成功率。歡迎免費咨詢,了解更多服務詳情!
中/英文項目報告
在技術報告中,百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:
實驗步驟(中英文)
相關的質譜參數(中英文)
化學蛋白質組學詳細信息
質譜圖片
原始數據
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質,提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種蛋白質標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
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