小 M, 小 M, 我導(dǎo)兒開始安排測 IC50 了,雖然查文獻(xiàn)經(jīng)常遇到……但還是暈,概念分不清?不懂如何測?有啥區(qū)別?確實!大家常在文獻(xiàn)中看到 IC50、EC50、ED50 等數(shù)值的測定,實驗不迷茫~我們先從大家最熟悉的 IC50 值開始。
IC50 (Half maximal inhibitory concentration) 又叫半數(shù)抑制濃度,So,單位是濃度單位,比如 nM、µM 等等。
我們常在文獻(xiàn)中看到 IC50、EC50、ED50 等等數(shù)值的測定,這些指標(biāo)被廣泛應(yīng)用于藥物開發(fā)、毒理學(xué)、基礎(chǔ)研究等領(lǐng)域,為理解藥物效應(yīng)和優(yōu)化治療策略提供了有力支持。
IC50 值的應(yīng)用:
初步篩選:在藥物發(fā)現(xiàn)過程中,IC50 值用于篩選潛在的藥物候選分子,以確定其對特定靶標(biāo)如酶抑制的活性。
優(yōu)化化合物:通過比較不同化合物的 IC50 值,研究人員可以優(yōu)化藥物分子的結(jié)構(gòu),提高其效能。
細(xì)胞生物學(xué)研究:IC50 用于評估化合物對癌細(xì)胞或其他細(xì)胞類型的毒性,幫助研究其對細(xì)胞生長和存活的影響。
毒理學(xué)研究:在藥物安全性評估中,IC50 值用于確定化合物對正常細(xì)胞的影響,評估其潛在的副作用。
一、激酶抑制劑的 IC50 值,如何測?
(2) IC50 值測定:對初篩所得 33 個分子化合物復(fù)篩 ,將其按實驗設(shè)計加入激酶反應(yīng)體系中,進(jìn)行 IC50 值測定。
(3) 發(fā)光測定:通過發(fā)光測定監(jiān)測 CaMKII-δ 磷酸轉(zhuǎn)移酶活性(注意:如果激酶反應(yīng)不是在室溫下進(jìn)行,在加入 ADP-Glo™ 試劑之前,將板平衡至室溫)。
(4) 記錄發(fā)光:使用微孔板讀數(shù)儀記錄讀數(shù)。
(5) 數(shù)據(jù)分析:數(shù)據(jù)以平均值 ±SEM 表示。使用 GraphPad Prism 版本 8.01 (GraphPad Software, Inc.) 和 SPSS 24.0 軟件包 (IBM SPSS Statistics,版本 24.0) 進(jìn)行統(tǒng)計分析。
當(dāng) CaMKII-δ 被激活時,它會通過將 ATP 轉(zhuǎn)化為 ADP 來磷酸化底物。在該測定中,CaMKII-δ 的肽底物 (Autocamtide-3) 的磷酸化與 ATP 到 ADP 的轉(zhuǎn)變酶促偶聯(lián)。ADP-Glo 試劑用于終止激酶反應(yīng)并去除未反應(yīng)的 ATP。加入激酶檢測試劑終止 ATP 消耗反應(yīng)并將 ADP 轉(zhuǎn)化為 ATP,然后通過熒光素酶反應(yīng)將 ATP 進(jìn)一步轉(zhuǎn)化為光。
二、細(xì)胞毒活性試驗的 IC50 值,如何測?
圖 3. 吡啶和噻唑衍生物對肺癌 (A549) 細(xì)胞系的抑制作用[2]。
(1) 化合物制備:將合成的化合物及參考藥物阿霉素溶解于 DMSO 中。準(zhǔn)備不同濃度的工作溶液以供實驗使用。
(2) 細(xì)胞處理:將預(yù)培養(yǎng)的細(xì)胞系暴露于不同濃度的測試材料,在 37°C 下孵育 24 小時。使用 PBS 清洗去除死細(xì)胞。
(3) MTT 染色:向每個孔加入 25 µL 0.5% MTT 染液。在 37°C 條件下孵育 3-4 小時。
(4) 溶解與讀數(shù):加入 0.05 mL DMSO 溶解細(xì)胞內(nèi)形成的甲瓚晶體,并在搖床上放置 30 min。利用 ELISA 板讀數(shù)儀測量各孔的吸光度值。
? IC50 值的數(shù)據(jù)處理
實驗設(shè)計:進(jìn)行細(xì)胞或酶實驗,將靶標(biāo) (如細(xì)胞系、酶等) 暴露于多個不同濃度的藥物中。
處理數(shù)據(jù):將所得表格數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)化,使用 Graphpad prism 軟件計算—創(chuàng)建表格—輸入濃度和抑制率—點擊 Analyze,選擇對數(shù)變換--通過非線性回歸 (Non-linear regression) 對實驗數(shù)據(jù)進(jìn)行擬合---得 IC50 值,其標(biāo)準(zhǔn)曲線為 S 型曲線。
圖 4. IC50 值的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
需要注意的是!雖然 IC50 的應(yīng)用十分廣泛,但 IC50 值是通過體外實驗獲得的,僅為體外數(shù)據(jù),不能完-全反映藥物在體內(nèi)復(fù)雜環(huán)境下的效果。
產(chǎn)品推薦 |
Thiazolyl Blue (HY-15924) MTT 是一種黃色的水溶性四唑鹽,活細(xì)胞線粒體中的脫氫酶可以將 MTT 還原成不溶性的紫色結(jié)晶甲瓚,通過測量甲瓚的顏色變化來反映細(xì)胞活力。 |
Cell Counting Kit-8 (HY-K0301) WST-8 在電子載體 1-Methoxy PMS 的作用下,可以被細(xì)胞內(nèi)脫氫酶還原成水溶性的橙黃色甲臜 (formazan)。 |
WST-1 (HY-136976) WST-1 誘導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)線粒體脫氫酶進(jìn)行 NADH 依賴的酶切反應(yīng),釋放出水溶性的甲臜產(chǎn)物,通過測定 450 nm 處的吸光值來反映細(xì)胞活力。 |
參考文獻(xiàn):
[1] Zhang J, et al. Novel CaMKII-δ Inhibitor Hesperadin Exerts Dual Functions to Ameliorate Cardiac Ischemia/Reperfusion Injury and Inhibit Tumor Growth. Circulation. 2022 Apr 12;145(15):1154-1168.
[2] Ashmawy FO, et al. Synthesis, In Vitro Evaluation and Molecular Docking Studies of Novel Thiophenyl Thiazolyl-Pyridine Hybrids as Potential Anticancer Agents. Molecules. 2023 May 23;28(11):4270.
[3] Gui, H., et al. Effects of Boletus Poisoning on Estrogen Receptors and Neurotransmitters in Rats Based on ERk1/2 Pathway. Neural Process Lett 55, 193–203 (2023).
[4] Abal P, et al. Acute Oral Toxicity of Tetrodotoxin in Mice: Determination of Lethal Dose 50 (LD50) and No Observed Adverse Effect Level (NOAEL). Toxins (Basel). 2017 Feb 24;9(3):75.
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