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蘇州珀羅汀生物技術(shù)有限公...

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解鎖膜蛋白的“金鑰匙”!

閱讀:220      發(fā)布時間:2025-2-20
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細胞膜是細胞與外界環(huán)境的分界線,而膜蛋白(MPs)作為細胞的基本組成成分,介導許多關(guān)鍵過程,如信號轉(zhuǎn)導、成分傳輸、酶反應、細胞之間的通信等。在生命科學領(lǐng)域,研究膜蛋白對于理解細胞功能、疾病機制及藥物開發(fā)具有重要意義。膜蛋白的表達與純化一直是研究中的難點,其復雜的結(jié)構(gòu)、疏水性、表達量、易形成包涵體以及潛在的毒性使得傳統(tǒng)表達方法面臨諸多挑戰(zhàn)。而無細胞蛋白表達技術(shù)( CFPS)的興起,為膜蛋白研究帶來了革命性的變革。


一、膜蛋白表達的挑戰(zhàn)


膜蛋白作為一類特殊的蛋白質(zhì),其表達與純化過程尤為復雜。除了常見的問題外(比如:膜蛋白定位、跨膜蛋白疏水性、蛋白毒性、表達水平低等),還有以下一些挑戰(zhàn):


稀有密碼子:部分膜蛋白基因含有稀有密碼子,這些密碼子不能被宿主細胞識別,導致多肽鏈合成不完-全,從而不能形成功能性膜蛋白。

易形成多聚體:膜蛋白在熱變性過程中容易形成多聚體,導致抗體無法識別或條帶分子量發(fā)生變化或扭曲,從而影響實驗結(jié)果。

提取方法復雜:由于膜蛋白與膜結(jié)合緊密,不易從膜上洗滌下來,特別是跨膜蛋白,具有多重跨膜結(jié)構(gòu)域,提取分離困難。目前常用的提取方法包括超速離心、密度梯度離心等,但每種方法都有其局限性。

檢測難度大:膜蛋白在樣品中的表達量通常不高,在總蛋白中占比較低,用總蛋白檢測時,目標蛋白含量可能低于檢測下限,無法檢測到。此外,膜蛋白的western Blot實驗也面臨諸多挑戰(zhàn),如條帶不清晰、分子量不對或條帶扭曲等。


二、CFPS技術(shù)在膜蛋白研究中的優(yōu)勢


對于體外結(jié)構(gòu)研究來說(如X射線衍射、核磁共振光譜或交聯(lián)方法等)CFPS已經(jīng)成為一個日益重要的研究領(lǐng)域,并且它在其他領(lǐng)域也有很高的潛力,包括工業(yè)蛋白質(zhì)生產(chǎn)等。一般來說,CFPS可以在不使用完整活細胞的情況下進行體外蛋白的合成,只需要合成系統(tǒng)中包含核糖體和氨基酰tRNA合成酶等核心蛋白質(zhì)表達機制的細胞提取物,同時提供能量恢復系統(tǒng)、氨基酸、NTP、tRNA和DNA等必需的前體即可。與重組蛋白生產(chǎn)相比,它有以下幾個主要優(yōu)勢:


  • CFPS可以表達對細胞有損害的蛋白質(zhì)或肽,包括膜整合蛋白、疫苗等;

  • CFPS系統(tǒng)允許通過不同的策略有效地納入非天然氨基酸(NSAA);

  • CFPS的蛋白純化過程可簡化為一兩個親和力純化步驟,表達后的提取物也可以直接應用于下游工作;

  • CFPS過程中免去了許多耗時和關(guān)鍵的步驟(比如細胞培養(yǎng));

  • CFPS允許在開放系統(tǒng)中直接解決降解、錯誤靶向或不溶性表達等問題,允許獨立于細胞活力或生長的情況下優(yōu)化蛋白質(zhì)生產(chǎn)。


總而言之,CFPS系統(tǒng)比重組系統(tǒng)具有優(yōu)勢,因為它的開放性允許精確控制環(huán)境,包括添加劑和氨基酸,并易于獲得表達的蛋白質(zhì)。此外,這些系統(tǒng)促進了適用于高吞吐量需求的簡單優(yōu)化程序,這使得它對自動化流程更具有吸引力,并且允許高效地納入非天然氨基酸。


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圖1:無細胞蛋白表達技術(shù)合成膜蛋白的實驗方案


三、CFPS技術(shù)在膜蛋白研究中的具體應用


CFPS系統(tǒng)是膜蛋白合成的一種新的核心平臺。其在人工疏水環(huán)境中的表達允許膜蛋白的共翻譯溶解和折疊,如納米膜或膠束。在沒有疏水化合物的情況下,合成的膜蛋白可定量沉淀,同時仍然可以保留很大一部分折疊的結(jié)構(gòu)元素。即使是復雜的膜蛋白(比如大型轉(zhuǎn)運體),也可以在幾個小時內(nèi)合成大量此類沉淀物。沉淀物可以在洗滌劑中溶解或重組成膜,以進行后續(xù)的結(jié)構(gòu)或功能分析。

我們知道,G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)在細胞-細胞信號傳導過程中發(fā)揮著核心作用,是人類基因組中最大的膜蛋白群體,大約35%的商業(yè)藥物是針對這些蛋白質(zhì)。對G蛋白偶聯(lián)受體進行結(jié)構(gòu)研究的先決條件是制備以毫克蛋白質(zhì)為單位的高度濃縮、穩(wěn)定且具有生物活性的樣本。傳統(tǒng)的表達方法會存在很多問題,而CFPS可以規(guī)避這些問題。基于其開放性,允許研究人員向系統(tǒng)中添加物質(zhì)。這促進了蛋白表達和溶解,允許快速篩選出最佳表達條件。

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圖2:作為藥物靶點的GPCRs系統(tǒng)發(fā)育樹


此外,膜基納米顆粒(如脂質(zhì)體、聚合物和脂質(zhì)納米顆粒)的表面改性,以及靶向分子(如結(jié)合蛋白)的修飾是治療材料設計的重要一步。然而,這種修飾可能既昂貴又耗時,需要細胞宿主進行蛋白質(zhì)表達,將會花費漫長的純化和共軛時間來將蛋白質(zhì)附著在納米載體表面,這最終限制了有效蛋白質(zhì)共軛納米載體的發(fā)展。目前,已有研究使用CFPS系統(tǒng)來快速創(chuàng)建蛋白質(zhì)共軛膜基納米載體。使用這種方法,多種類型的功能結(jié)合蛋白,包括affibodies、scFvs等,都可以通過無細胞表達,并在一個鍋中結(jié)合到脂質(zhì)體上。此外,可以進一步擴展到其他納米顆粒,包括聚合物和脂質(zhì)納米顆粒,適用于多種共軛策略,包括表面附著以及集成到納米顆粒膜中。利用這些方法,證明了雙特異性人工抗原呈遞細胞的快速設計,并增強了脂質(zhì)納米顆粒貨物的體外輸送。預計這種工作流程將能夠快速生成基于膜的輸送系統(tǒng),并增強我們創(chuàng)建細胞模仿療法的能力。


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圖3:膜基納米顆粒的快速合成

四、總結(jié)


CFPS技術(shù)正引膜蛋白研究的革命性突破,它不僅解鎖了膜蛋白研究的新篇章,還預示著在結(jié)構(gòu)生物學、藥物研發(fā)和生物傳感器技術(shù)等前沿領(lǐng)域的無限可能。隨著技術(shù)的日益完善,我們有充分的理由期待,這項技術(shù)將極大促進膜蛋白功能的深刻理解,加速新藥研發(fā)進程,并為生命科學的深入探索提供強有力的技術(shù)支持,為人類的健康福祉和科技進步貢獻力量。

珀羅汀生物依托自主研發(fā)的無細胞蛋白表達平臺,已成功實現(xiàn)對膜蛋白的高效快速合成,成為膜蛋白表達的救星。


參考文獻:

  1. Schmidt P, Bender BJ, Kaiser A, et al. Improved in Vitro Folding of the Y2 G Protein-Coupled Receptor into Bicelles. Front Mol Biosci. 2018;4:100. Published 2018 Jan 17. doi:10.3389/fmolb.2017.00100.

  2. Goncharuk MV, Vasileva EV, Ananiev EA, et al. Facade-Based Bicelles as a New Tool for Production of Active Membrane Proteins in a Cell-Free System. Int J Mol Sci. 2023;24(19):14864. Published 2023 Oct 3. doi:10.3390/ijms241914864.

  3. Manzer ZA, Selivanovitch E, Ostwalt AR, Daniel S. Membrane protein synthesis: no cells required. Trends Biochem Sci. 2023;48(7):642-654. doi:10.1016/j.tibs.2023.03.006.

  4. Peruzzi JA, Vu TQ, Gunnels TF, Kamat NP. Rapid Generation of Therapeutic Nanoparticles Using Cell-Free Expression Systems. Small Methods. 2023;7(12):e2201718. doi:10.1002/smtd.202201718.



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