分子與細胞生物學,
蛋白質組學或者
抗體藥物開發的過程中,通常需要對
蛋白樣品進行濃縮,以提高樣品的濃度并進行后續的實驗分析。盡管蛋白樣品濃縮的實驗室常規方法有多種,然而,
離心濃縮方法由于具有
快速、高通量的特點,每次可處理多達 100 – 200個樣品,因而越來越普及。
,
蛋白質的性質比較“嬌貴",
溫度稍高就容易失活,甚至變性而沉淀下來,造成實際有效樣品的損失。因此,對蛋白樣品進行離心濃縮過程中,需注意控制樣品的溫度。
也許會有小伙伴問,蛋白質在濃縮的過程中溫度會怎樣變化呢?會升高還是降低?要想說清楚這個問題,就必須先從
離心濃縮儀的原理講起。
離心濃縮儀主要依靠兩個機制加速樣品溶劑的蒸發而達到濃縮目的:一是
抽真空,二是
加熱。
抽真空是依靠
降低樣品上方的蒸氣壓來加速樣品中溶劑的蒸發,所以離心濃縮儀都有一個
真空泵,同時配備一個冷阱,讓
冷阱中的低溫造成極低的蒸氣壓。此外,一般非溫度敏感的樣品,其溶劑也可通過也可通過離心腔室本身配有的加熱裝置加速揮發,從而更快地被真空系統抽走。
離心濃縮儀原理圖 另外,這里還有一個大家經常混淆的概念:
冷阱溫度和樣本溫度的關系
圖中冷阱的作用是為了使用低溫造成極低的蒸氣壓,通過相連的管道與樣品的蒸氣壓形成壓差,把溶劑蒸汽“抽到"冷阱里或通過真空泵排出系統。圖中可以看出,冷阱與樣本離心區處于不同的腔體,因此蛋白樣品在濃縮過程中的溫度與冷阱沒有關系,冷阱溫度再低,樣品的溫度也可能在室溫以上。
所以冷阱溫度不會直接明顯影響樣本溫度! 所以,為了保證“嬌貴"的蛋白質能夠保持活性,我們需要采用其他方式管控離心區的樣本溫度!
首先,我們來看看
蛋白樣品離心濃縮過程的溫度變化,這將幫助我們認識應當如何調控溫度。如前所述,對于蛋白類樣品而言,由于其對溫度敏感,加熱蒸發方式較少采用,而主要是依靠抽真空來加速溶劑蒸發。所以我們這里主要看抽真空條件下樣本溫度的變化。使用單純的抽真空方式對蛋白樣品進行離心濃縮,樣品的溫度也并非恒定在室溫上下,而是經歷一個
先降溫后升溫的過程。
在
濃縮初期,由于樣品中的溶劑快速蒸發會帶走大量的熱量,
樣品溫度隨之而下降,甚至可能降到熔點以下,導致
樣品凍結,蒸發速率不但沒有加快反而變慢(畢竟冰的升華要比水的蒸發慢很多)。隨著蒸發的不斷進行,樣品量越來越少,溶劑蒸發速度也就越來越慢,
樣品的溫度就會慢慢回升。與此同時,離心濃縮儀的馬達因為快速旋轉而產熱,并不斷地將熱量帶到離心腔室中,樣品就會
被動加熱。有數據顯示,即使不開啟加熱功能,馬達產熱也可能讓樣品溫度達到50℃以上。
離心腔室和樣品的溫度變化示意圖
然而蛋白樣品既不能忍受反復凍融,也不能忍受高溫。那我們
怎么才能做到既快速濃縮,又保持蛋白活性?
您既需要“寶馬",也需要“金鞍"。
這匹“
寶馬",就是一臺既能升溫也能降溫的離心濃縮儀。
賽默飛的SpeedVac SRF110就是一款非常適合蛋白濃縮的離心濃縮儀,它的離心室溫控范圍是-4 – 100℃,且連續可調,它還允許我們編寫具有兩個段落的程序,使得實驗前期和后期的條件有所不同。
Thermo Scientific SpeedVac SRF110型離心濃縮儀(離心腔)
“金鞍"就是我們的
實驗條件設置了。我們可以充分利用SpeedVac SRF110的特性,編寫一個程序,讓
濃縮的前期和后期實驗條件不一樣。在
一開始,樣品中的水比較多,蒸發會帶走熱量,此時我們不宜將溫度設得太低,一般可以設到
20 – 30℃之間,樣品自然降溫的同時腔室微微加熱,以防樣品溫度降得過低。如果我們的目的是希望樣品中的水分盡可能地少一些,那么在實驗的
最后大約0.5 -- 1小時左右的時侯,需要
主動降溫,將樣品保持在比較安全的溫度范圍內,通常建議4 – 10℃。
當然,不同的樣品,
不同的實驗目的和要求需要不同的條件,我們如果能將上面講的原則活學活用,一定能得到的實驗效果。
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