在微生物診斷中，離心機通常用于將被測微生物從被檢物料中分離出來，并獲得純培養物（即單個微生物的培養物），因此，通常用離心機對樣品進行分離。微生物的離心分離培養方式是微生物學診斷中的一項重要基本操作。

分離單個微生物的方法很多：

1、將被檢物料接種在合適的微生物培養基中，然后從固體培養基表面產生的細菌中選擇一個待分離的細菌，并將其轉移到另一個合適的微生物培養基中進行培養。由于單個細菌體通常由單個細菌生成繁殖產生，因此培養的細菌是單一類型，即純培養；

2、利用*的培養環境（如厭氧、二氧化碳環境等）進行細菌分離；

將被檢物料接到子易患動物身體內，使致病菌在動物體內繁殖，然后從動物體內取出物料用離心機離心分離出所需的成分，然后進行培養。用對部分理化要素具有*抵抗力的細菌，用理化方法處理接種物料，殺死其他微生物，保留所需的細菌進行分離培養。

通常，可以用前兩種方法分離和培養被檢物料。如果被檢物料污染嚴重，可先用后兩種方法處理，然后再用前兩種方法進行純培養。

在分離培養操作中，嚴格執行無菌操作。所有用品、微生物培養基和試劑必須消毒，不能長時間暴露在空氣中，禁止用手觸摸或用嘴吹已殺菌的器皿內部。

被檢物料中可能存在病原苗的特點，選擇合適的微生物培養基和培養條件：（溫度、氣體環境等）。對不明細菌進行初步分離時，最好多使用幾種微生物培養基，如肉湯、血瓊脂、麥康克瓊脂等，每種微生物培養基接種幾根試管，分別在普通環境和厭氧環境中培養。通過24-78小時觀察結果，但一些病原體需要在長時間培養后才能生成。

被檢物料通常不需要處理，可以直接種植在微生物培養基上。當懷疑為帶芽腦的病原苗時，加入生理鹽水將被檢物料研磨成1:10的乳劑（液體物料不需要稀釋），放入60-80℃的水浴中20-30分鐘，殺死無芽胞的雜菌，然后接種在微生物培養基中。

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