使用磷酸化抗體時,需要注意以下事項以確保實驗結果的準確性和可靠性:
樣本處理:
加入抑制劑:在裂解緩沖液(lysis buffer)中必須加入蛋白酶抑制劑和適量的磷酸酶抑制劑,以抑制組織或細胞裂解過程中釋放的內源性蛋白磷酸酶,防止磷酸化蛋白去磷酸化,從而維持蛋白質的磷酸化狀態。
確保裂解:建議使用裂解液裂解結合超聲處理,確保細胞充分裂解并剪切染色質DNA。超聲處理時應保持低溫,避免蛋白降解。
新鮮樣本:使用新鮮制備的樣本,避免反復凍融,以減少磷酸基團的降解。
抗體孵育:
低溫孵育:一抗孵育最好在4°C下進行,并過夜孵育,以確保抗體與目的蛋白充分結合。低溫有助于維持抗體與抗原的物理吸附,防止高溫下抗原脫落。
稀釋液選擇:根據產品說明書推薦的稀釋液稀釋抗體,通常建議使用含5%牛血清白蛋白(BSA)的TBST稀釋液,而非含脫脂牛奶的TBST,因為脫脂牛奶中可能含有磷酸化蛋白,影響實驗結果。
洗滌條件:
洗滌液選擇:推薦使用TBST作為洗滌液,相對于PBST,TBST能提供更強的信號。
洗滌次數和時間:洗滌次數和時間需要優化,以避免信號減弱或背景增加。通常建議一抗和二抗孵育后,用TBST洗膜3次,每次5分鐘。
封閉條件:
封閉劑選擇:雖然網絡上流傳磷酸化抗體不適于用牛奶封閉的說法,但使用實驗級脫脂牛奶進行室溫封閉1小時是有效的,且有助于降低非特異性結合。
封閉時間:避免膜封閉時間過長,以免掩蓋抗原表位,阻止抗體結合。
對照設置:
陽性對照:設置合適的陽性對照,以確認抗體檢測到的特異性信號。
總蛋白和內參對照:除了檢測磷酸化蛋白外,還應檢測該蛋白的總表達量,以及使用普通內參作為體系對照,保證上樣量一致。
實驗環境:
低溫環境:在整個實驗過程中,除超聲處理外,應保持低溫環境,以防止磷酸化蛋白在室溫下被蛋白磷酸酶降解。
結果分析:
分子量比對:在壓片后,根據marker比對條帶的分子量,確認檢測到的條帶是否正確。
曝光時間:優化曝光或壓片時間,以避免背景過深或條帶過淺。
抗體質量:
選擇高質量抗體:確保使用的磷酸化抗體質量可靠,并嚴格按照抗體說明書進行操作。
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