慢病毒背景
慢病毒載體(Lentiviral vectors, LVs)是在人免疫缺陷病毒HIV-1的基礎上改造而來的,可以將大量的遺傳信息傳遞進宿主細胞,并且整合到細胞的基因組內,使其可以在細胞內穩定表達若干代。同時,由于它的毒力基因已經被剔除,作為假病毒可以在實驗室內較為安全的使用。慢病毒載體可以轉染多種細胞,包含原代細胞等難轉染的細胞。
慢病毒在Car-T細胞療法中的應用
基于慢病毒具有:
感染范圍廣、效率高,有效感染分裂和非分裂的細胞;
穩定性強,整合進基因組中,長期穩定表達外源的基因;
免疫原性低,安全性相對較高的特點,慢病毒被廣泛應用于細胞治療中。
CAR-T(Chimeric Antigen Receptor T-cell,嵌合抗原受體T細胞)療法是一種突破性免疫療法,通過基因改造患者的T細胞,使其表達特定的CAR(嵌合抗原受體),從而識別并殺傷腫瘤細胞。目前主要用于血液系統惡性腫瘤(如B細胞白血病、淋巴瘤),并逐步向實體瘤拓展。
慢病毒整合的特性
慢病毒是目前CAR-T主流轉導方式(FDA已批準的CAR-T產品中,約90%采用LV),慢病毒整合在細胞內是半隨機整合(偏好轉錄活躍區)。
1
慢病毒通過識別宿主表面受體,把RNA和蛋白轉運至胞內;
2
病毒RNA逆轉錄形成線性 雙鏈cDNA(含兩端LTR序列)
3
整合酶識別LTR,cDNA被整合到宿主基因組中;
4
外源基因隨宿主細胞分裂持續表達。
整合偏好性:
整合位點分析(Integration Site Analysis, ISA)是基因治療產品(如CAR-T)臨床開發和上市后監測的關鍵環節,其法規要求由各國監管機構(如FDA、EMA)制定,旨在評估基因組整合的潛在風險(如插入突變、克隆擴增)。
目前檢測ISA的方法有LM-PCR、NGS、單細胞測序等,為了保證檢測的準確性,科佰生物開發了一系列慢病毒整合位點標準品供檢測機構使用,作為品質衡量的標尺對檢測能力進行判別。在前文 慢病毒整合位點標準品強勢來襲一文中,已對單克隆多插入位點、單克隆單插入位點、性染色體插入位點 做了產品的說明及數據展示。近期科佰推出了5% 2% 整合頻率的慢病毒多克隆多整合位點參考品,由多個單克隆整合位點產品混合而來,覆蓋20個插入位點,分別來自11個不同染色體上的20個基因,如下表所示
Figure 1. 基因分布
Figure 2. 染色體分布
每個位點經過LM-PCR(用于識別已知DNA與相鄰未知DNA的一種技術,可結合NGS,對IS進行高通量分析)、 NGS(捕獲探針法測序)技術檢測,Sanger測序驗證,以及dPCR檢測定標整合頻率,確保插入位點的準確定位和整合頻率的精準測量。
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產品列表
貨號 | 名稱 |
CBPL0007 | 慢病毒多克隆多整合位點參考品-5% |
CBPL0008 | 慢病毒多克隆多整合位點參考品-2% |
部分數據展示:
5% chr3:4871944 ITPR1四種檢測結果:
LM-PCR結果
NGS結果
Sanger結果
3'LTR+ITPR1 chr3_4871940
ITPR1 chr3_4871944+5'LTR
dPCR結果
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